Celem programu Mali Wielcy Odkrywcy jest propagowanie edukacji przez zachęcanie dzieci do przeprowadzania doświadczeń. Program ma zainteresować dzieci nauką i wzbudzić w nich chęci do poznawania otaczającego je świata. Zajęcia są pełne eksperymentów, doświadczeń i praktycznych obserwacji.
Program podzielony jest na trzy etapy.
Każdy z etapów przewidziano na jeden tydzień zajęć (od poniedziałku do piątku).
Pierwszy etap dotyczy drzew. W trakcie zajęć dzieci poznają między innymi proces fotosyntezy, rodzaje drzew oraz ich owoce, wykonują również ćwiczenia sensoryczne.
Drugi etap dotyczy wody. W trakcie zajęć dzieci poznają między innymi stany skupienia wody czy jej gęstość, wykonują również ćwiczenia ze złudzeniami optycznymi i wypornością.
Trzeci etap dotyczy jednostek miary. Podczas zajęć dzieci uczą się określać długość, masę, temperaturę, czas oraz objętość.